يقع مسجد السلطان محمد الفاتح، الذي هو قيد الإنشاء، في شرق مدينة قلقيلية (صوفين) الواقعة في شمال الضفة الغربية بفلسطين المحتلة، ويعتبر هذا المسجد واجة مدينة قلقيلية كونه يقع في المدخل الرئيس للمدينة.
سمي المسجد باسم السلطان محمد الفاتح نسبة إلى السلطان العثماني الذي فتح إسطنبول، وقد ورد المدح لمن يفتح هذا البلد في حديث النبي صلى الله عليه وسلم " لتُفتَحن القسطنطينية فلَنعمَ الأمير أميرها ولنعم الجيش ذلك الجيش ". وقد صمم منبر المسجد في هيئته ليشبه الخوذة التي كان يلبسها السلطان محمد الفاتح. يتكون مسجد السلطان محمد الفاتح من قاعة الصلاة الرئيسية، يعلوها قبة صفراء أكثر شبه بقبة الصخرة المشرفة، قطر قبة المسجد 12.20 متر، ويبلغ ارتفاع القبة عن ارض المسجد 21 متر. وقد صمم المسجد بالطراز السلطاني العثماني، ثماني الاضلاع ليكون الضلع الجنوبي باتجاه القبلة تماماً، والباب الرئيسي للمسجد من الجهة الشرقية. واضيف جزء فيه بطابق ثان (سدة) للصلاة من الجهة الشمالية. حيث تبلغ مساحة البناء للمسجد دون المرفقات له مثل المتوضأ والحمامات حوالي 654 متر مربع، اما المساحة الكلية 1000 متر مريع.
وقد ارفق المسجد بمتوضأ وحمامات من الجهة الشمالية تحت قبة صغيرة تحاكي قبة المسجد بالحسن والجمال وروعة المنظر، ويربطها بالمسجد رواق مصمم بالطراز التركي الشامي القديم.
ولمسجد السلطان محمد الفاتح مئذنتين تعلوانه من الجهة القبلية تحتضنان القبة الصفراء في صورة تعبر عن اصالة المسجد وعظمة بيوت الرحمن. حيث ترتفع كل مئذنة أكثر من 55 متر عن ارض المسجد، 43 متر من الحجر الأبيض، يتخللها صحن أو شرفة من الحجر المقوس، ويعلو كل مئذنة قبة اسطوانية تشع منها الانوار، يقارب ارتفاعها 15 متر ليصبح ارتفاع كل مئذنة أكثر من 55 متر.